Lisa（曼迪·摩尔 Mandy Moore 饰）和Kate（克莱尔·霍尔特 Claire Holt 饰）两姐妹在墨西哥海岸度假，她们在海底观鲨铁笼中潜水观赏鲨鱼时，牵连铁笼的绳子突然断裂，观鲨笼掉落到47米深的海底。由于所存氧气不多，她们只有一个小时的时间逃脱牢笼回到水面。而此时，大白鲨也在她们周围游弋着。47米深的海底一片漆黑，只能通过手电筒观察铁笼外面的情况。水面上工作人员的声音时有时无，救援队也迟迟不见踪影，姐妹俩都非常害怕。面对仅剩的氧气，她们必须马上做出选择才有一线生机。为了避开鲨鱼活着游出水面，姐妹两人与鲨鱼之间展开了一场斗智斗勇扣人心弦的生死较量……

小智和皮卡丘等一行伙伴在旅途中前行。某日，宝可梦波尔凯尼恩从天而降并被迫与小智锁在了一起。波尔凯尼恩与被人类伤害过的宝可梦们共同生活，因此非常讨厌人类，但这条神奇的锁链却让他们无法分开，奇妙的故事就此开始。小智与皮卡丘又将一起开始新的冒险…… 另一方面，在超级机关城市阿佐特王国，大臣贾维斯得到了常年追求的终极发明——500 年前诞生于阿佐特王国的人造宝可梦玛机雅娜。据说在玛机雅娜体内，有被称为 “魂心”的未知力量，贪婪又邪恶的贾维斯企图利用这股力量来统治王国。小智和波尔凯尼恩将会如何化解彼此的嫌隙？波尔凯尼恩与玛机雅娜又有着怎样的渊源？他们要如何共同对抗贾维斯拯救阿佐特王国？玛机雅娜的最终命运又将如何结局？一场精灵宝可梦史上最伟大的战役即将展开！

约翰·哈蒙以前是中央情报局/缉毒局特工。一日，缉毒局的贝克找到约翰，告诉他：半岛基地组织恐怖分子阿卜杜拉在墨西哥边境偷渡被捕，调查发现，伊斯兰恐怖团伙将利用墨西哥何塞·里维拉的贩毒走私路线，输送恐怖武器及人员进入美国。因此，贝克让约翰复出，组织人员阻止破坏二者的结盟。约翰同意复出，但提出任用他自己的人及设备。墨西哥贩毒团伙老大何塞·里维拉，近期在伊斯坦布尔扩展毒贩业务，不断除掉那里的毒枭，霸占毒品销售市场。约翰·哈蒙的搭档是诱人的FBI女特工扎拉，由她向约翰推荐一间谍无人机监控员马修·夏普。约翰推断何塞·里维拉将在伊斯坦布尔召开会议，于是三人飞往伊斯坦布尔。在伊斯坦布尔酒店，何塞·里维拉与黎巴嫩真主党二号人物阿杨·穆贾希德会面，穆贾希德准备让里维拉输送恐怖分子阿卜杜尔·劳夫至美国……

　　克林特·伊斯特伍德之子斯科特·伊斯特伍德子承父业担纲西部动作猛片，内战退役士兵妻子被掳，求平凡生活不得只能大开杀戒成为暗黑杀神

自从上次蛇蛙大战后，蛙国又恢复了和平繁荣的生活。可是，和平的日子没持续多久，奇怪的事件又再降临青蛙王国。一张写着大祸即将降临青蛙王国的传单，散落在蛙国各地，关于“水晶青蛙”的传说正流传于民间。

　　太一等人因为狮子兽的死产生了动摇，而光子郎则提议找出缅因猫兽被感染的真相。但作为缅因猫兽主人的芽心却想不到为何缅因猫兽会被感染。
　　为了防止其他数码宝贝被感染，光子郎在办公室建立了隔离区，然而巴达兽却已经出现了被感染的征兆……此时，数码宝贝们告知了大家一个有关数码宝贝世界的重大秘密。面对秘密的真相以及再度出现的缅因猫兽，太一等人陷入了苦恼当中，而在各自的想法碰撞中，他们也做出了自己的决断……“如果总是想着总有一天会怎么样的话，那么就不知不觉要成为大人了哦。”现在，冒险再度进化。

　　奥尔法兽事件过后，随着时间流逝，御台场地区也渐渐复兴著。
　　“回到日本之后，我就决定一定要去大大的澡堂泡澡！”因为美美这句话，加上为了欢迎新加入的伙伴芽心和缅因猫兽，大家前往附近的温泉主题公园。虽然度过了一段开心的时光，但是这儿并没有阿丈的身影。
　　面对高考临近的事实，他在高考和“被选召的孩子们”的使命之间产生了烦恼。“为什么又必须是我们去面对啊？”
　　这个时候，在御台场再度出现了感染的数码宝贝、这是拥有着高傲灵魂的奥加兽。而看着电视中奥加兽的暴走，美美和巴鲁兽决定出击。“必须要让人们知道，也有好的数码宝贝！”
　　然而，美美和巴鲁兽无视光子郎而参与的战斗，却造成了意想不到的结果。各自怀揣烦恼的阿丈与美美。在月岛综合高中文化祭当天，一个男人出现在了他们面前。
　　如今，冒险再度进化……

本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。